30 września 2005 r. w Akademii Marynarki Wojennej im. Bohaterów Westerplatte w Gdyni odbyła się uroczysta inauguracja roku akademickiego 2005/2006. W trakcie uroczystości wręczono Medal Eugeniusza Kwiatkowskiiego doktorowi honoris causa Akademii MW, członkowi zwyczajnemu i honorowemu Stowarzyszenia Oficerów Marynarki Wojennej RP, admirałowi Henrykowi PIETRASZKIEWICZOWI.
W uzasadnieniu Kapituła Medalu Eugeniusza Kwiatkowskiego napisała:
W uznaniu Pana najwyższego autorytetu zawodowego i moralnego oraz bardzo znaczącego nieprzemijającego wkładu w odbudowę i rozwój Marynarki Wojennej RP Kapituła ma zaszczyt przyznać Panu
